Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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