Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms