Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms