Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2E1P51965 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms