Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRHP20396 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRHP20396 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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