Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms