Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A4Q9Y6R1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms