Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPK3Q9UPE1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPK3Q9UPE1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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