Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ZNF608Q9ULD9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ZNF608Q9ULD9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ZNF608Q9ULD9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ZNF608Q9ULD9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms