Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO3A1Q9UIG8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLCO3A1Q9UIG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms