Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP36Q9P275 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms