Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BARHL2Q9NY43 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms