Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM9Q9NXL9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms