Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM248Q9NWD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM248Q9NWD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms