Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms