Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L1Q9NUJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms