Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATG3Q9NT62 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms