Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLMQ9NP87 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLMQ9NP87 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLMQ9NP87 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms