Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BCAS3Q9H6U6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms