Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VCXQ9H320 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCXQ9H320 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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