Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms