Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mrpl20Q9CQL4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl20Q9CQL4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms