Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LNPKQ9C0E8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LNPKQ9C0E8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms