Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms