Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOK1Q9BRS2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms