Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHOX2BQ99453 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms