Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN4Q96NY8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN4Q96NY8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms