Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms