Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM8Q96KF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM8Q96KF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms