Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED3Q96IU2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms