Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFRP2Q96HF1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms