Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARF2Q96GP6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF2Q96GP6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.7 ms