Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms