Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRG4Q92954 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRG4Q92954 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms