Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC197Q8NCU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC197Q8NCU1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms