Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM199Q8N511 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM199Q8N511 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM199Q8N511 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM199Q8N511 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM199Q8N511 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms