Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS2Q86YH6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS2Q86YH6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms