Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPGS1Q6ZTW0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms