Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD40Q6AI12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms