Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF17Q5VTA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF17Q5VTA0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms