Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD3Q5T447 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms