Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDCA8Q53HL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDCA8Q53HL2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDCA8Q53HL2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms