Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A4Q4VNC1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A4Q4VNC1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A4Q4VNC1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms