Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBRG1Q3YBR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms