Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms