Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPROQ16827 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPROQ16827 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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