Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA2Q15596 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA2Q15596 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA2Q15596 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA2Q15596 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA2Q15596 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCOA2Q15596 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCOA2Q15596 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA2Q15596 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA2Q15596 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCOA2Q15596 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NCOA2Q15596 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NCOA2Q15596 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NCOA2Q15596 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms