Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDSNQ15517 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDSNQ15517 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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