Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PUM3Q15397 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PUM3Q15397 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PUM3Q15397 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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