Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YIR007WYIR007W 2295 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 GEX1YCL073C 1848 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 GEX2YKR106W 1848 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 LAP2YNL045W 2016 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SLD2YKL108W 1362 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 RTT106YNL206C 1368 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 MNN5YJL186W 1761 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 ALT1YLR089C 1779 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 DXO1YDR370C 1329 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 GSY2YLR258W 2118 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 RMD1YDL001W 1293 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 HST4YDR191W 1113 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YDR222WYDR222W 1248 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 MHR1YDR296W 681 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 PRO3YER023W 861 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 RPT6YGL048C 1218 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 MTG1YMR097C 1104 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YIP3YNL044W 531 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YOL163WYOL163W 510 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 OSW1YOR255W 837 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 BTS1YPL069C 1008 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YBR089WYBR089W 600 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 CKS1YBR135W 453 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 RER1YCL001W 567 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 KKQ8YKL168C 2175 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 NDC1YML031W 1968 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YDR109CYDR109C 2148 nt5.8□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 VPS36YLR417W 1701 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 HIR1YBL008W 2523 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SNM1YDR478W 597 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 CWC21YDR482C 408 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 TRP5YGL026C 2124 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YHR054CYHR054C 1065 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 WSS1YHR134W 810 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SPO16YHR153C 597 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YKL169CYKL169C 384 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YNL296WYNL296W 315 nt5.79□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 NSE3YDR288W 912 nt5.78□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SLO1YER180C-A 258 nt5.78□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YGL262WYGL262W 528 nt5.78□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 ARD1YHR013C 717 nt5.78□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YLL059CYLL059C 507 nt5.78□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 ATP14YLR295C 375 nt5.78□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 FAT3YKL187C 2253 nt5.78□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 OXP1YKL215C 3861 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 CMK1YFR014C 1341 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 COT1YOR316C 1320 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YDL026WYDL026W 312 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 UTR4YEL038W 684 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MER1YNL210W 813 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 ATG19YOL082W 1248 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YOR318CYOR318C 306 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 snR189snR189 189 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 IMA2YOL157C 1770 nt5.77□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MRPL32YCR003W 552 nt5.76□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 GET3YDL100C 1065 nt5.76□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 SCL1YGL011C 759 nt5.76□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 DJP1YIR004W 1299 nt5.76□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 BLS1YLR408C 369 nt5.76□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MSS1YMR023C 1581 nt5.76□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 ABD1YBR236C 1311 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MCM3YEL032W 2916 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 INO2YDR123C 915 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 FMP48YGR052W 1110 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MRPL6YHR147C 645 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 APS3YJL024C 585 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YLR296WYLR296W 327 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 PSH1YOL054W 1221 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 SAM4YPL273W 978 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 SLM4YBR077C 489 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 FET3YMR058W 1911 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 RIM101YHL027W 1878 nt5.75□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 UGO1YDR470C 1509 nt5.74□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MAD3YJL013C 1548 nt5.74□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YLL047WYLL047W 384 nt5.74□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 TFS1YLR178C 660 nt5.74□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 GUA1YMR217W 1578 nt5.74□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 SET4YJL105W 1683 nt5.74□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 URA7YBL039C 1740 nt5.74□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 CAD1YDR423C 1230 nt5.73□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YHR095WYHR095W 495 nt5.73□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 SAW1YAL027W 786 nt5.73□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 HCR1YLR192C 798 nt5.73□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 CTL1YMR180C 963 nt5.73□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MTC1YJL123C 1437 nt5.73□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 FRE7YOL152W 1863 nt5.73□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YCR016WYCR016W 873 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YDR249CYDR249C 1122 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YDR336WYDR336W 945 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 COS9YKL219W 1224 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YKR073CYKR073C 321 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 ARG8YOL140W 1272 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 YOR289WYOR289W 756 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MRL1YPR079W 1146 nt5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms